截至2016年6月底，全國醫療衛生機構數達98.9萬個，其中：醫院2.8萬個，基層醫療衛生機構92.7萬個，專業公共衛生機構3.1萬個，其他機構0.3萬個。與2015年6月底比較，全國醫療衛生機構增加3160個，其中：醫院增加1804個，基層醫療衛生機構增加5698個，專業公共衛生機構減少4222個。
醫院中：公立醫院12958個，民營醫院15303個。與2015年6月底比較，公立醫院減少380個，民營醫院增加2184個。
基層醫療衛生機構中：社區衛生服務中心(站)3.4 萬個，鄉鎮衛生院3.7 萬個，村衛生室64.3萬個，診所(醫務室)19.9萬個。與2015年6月底比較，診所增加，社區衛生服務中心（站）、鄉鎮衛生院和村衛生室減少（見表1）。
專業公共衛生機構中：疾病預防控制中心3484個，衛生監督所（中心）3173個。與2015年6月底比較，疾病預防控制中心減少5個，衛生監督所（中心）增加44個。
各地區醫療衛生機構數見表2。
有關調查表明，我國民營醫院的發展存在失衡的現象，主要表現為區域分布不均、城鄉分布不均、城市分布不均。
第一，區域分布不均。
東部及沿海地區的民營醫院在數量、規模、經營狀況等方面都要好于中西部地區。造成這一現象的原因首先是東部及沿海地區的政府及相關部門對民營醫院的重視程度更高，對推進新醫改的力度相較于中西部地區也更大。其次東部及沿海地區的經濟發展較好，具有豐富的社會資本去開設民營醫院。而中部、西部地區在經濟發展上有一定的差距，民營醫院投入的資本相對較少，因此在規模和經營上落后于東部及沿海地區。
第二，城鄉分布不均。
城市民營醫院聚集度更高，鄉鎮民營醫院除鄉村私人診所外，則仍以公立醫院為主。這主要與城鄉經濟發展的差距有一定關系，經濟發達才有足夠的社會資本去興辦民營醫院。此外，鄉鎮在對民營醫院的扶持政策上遠不如城市力度大，在一定程度上也不利于鄉鎮民營醫院的發展。
第三，城市分布不均。
例如江蘇、浙江、山西、福建等地城市的民營醫院聚集度更高，廣西、青海、寧夏等地城市的民營醫院聚集度較低。相對于一個大中城市而言，民營醫院的院址選擇，既要和城市規劃建設相聯系，又要考慮到城市社區人口集聚相對集中的地段，以方便居民就醫的需要，使民營醫院能夠更好地服務于城市社區居民。
